1. Поток

«Люди пытаются разглядеть море угроз через игольное ушко». Почему так трудно обнаруживать опасные вирусы

Глав­ная про­бле­ма ви­ру­со­ло­гии — об­на­ру­жить ма­ло­изу­чен­ные ви­ру­сы с по­мо­щью рас­про­стра­нен­ных ме­то­дов те­сти­ро­ва­ния прак­ти­че­ски невоз­мож­но. Об этом го­во­рят ав­то­ры об­зо­ра ме­то­дов ди­а­гно­сти­ки в на­уч­ном жур­на­ле Viruses, со­об­ща­ет пресс-служ­ба МФТИ. Сре­ди ав­то­ров — со­труд­ни­ки Мос­ков­ско­го фи­зи­ко-тех­ни­че­ско­го ин­сти­ту­та, Цен­тра стра­те­ги­че­ско­го пла­ни­ро­ва­ния Ми­ни­стер­ства здра­во­охра­не­ния Рос­сии, мос­ков­ско­го Се­че­нов­ско­го уни­вер­си­те­та и ин­сти­ту­та Па­сте­ра в Санкт-Пе­тер­бур­ге.







«По раз­ным ста­ти­сти­че­ским оцен­кам на на­шей пла­не­те на­счи­ты­ва­ет­ся бо­лее 320 ты­сяч раз­лич­ных ви­ру­сов, па­ра­зи­ти­ру­ю­щих на мле­ко­пи­та­ю­щих, — объ­яс­ня­ет со­труд­ник МФТИ Ка­миль Ха­физов. — Но из та­ко­го ги­гант­ско­го раз­но­об­ра­зия че­ло­ве­ку пока уда­лось бо­лее-ме­нее изу­чить мень­ше од­но­го про­цен­та этих за­га­доч­ных ор­га­низ­мов».

Боль­шин­ство ви­ру­сов, в том чис­ле тех, что вы­зы­ва­ют у че­ло­ве­ка ре­спи­ра­тор­ные, ки­шеч­ные и дру­гие па­то­ло­гии, оста­ют­ся неизу­чен­ны­ми и по­то­му прак­ти­че­ски нерас­по­зна­ва­е­мы­ми. Дело в том, что по­пу­ляр­ные тест-си­сте­мы спо­соб­ны вы­яв­лять толь­ко кон­крет­ные, хо­ро­шо изу­чен­ные штам­мы ви­ру­са.

«Фак­ти­че­ски люди пы­та­ют­ся раз­гля­деть огром­ное море угроз че­рез иголь­ное ушко», — пи­шут ав­то­ры об­зо­ра. На­при­мер, ПЦР-ди­а­гно­сти­ка — ос­нов­ной для со­вре­мен­ной ме­ди­ци­ны спо­соб те­сти­ро­ва­ния. Он прак­ти­че­ски не поз­во­ля­ет об­на­ру­жить ма­ло­изу­чен­ные ви­ру­сы, что со­став­ля­ет одну из глав­ных про­блем со­вре­мен­ной ви­ру­со­ло­гии.

Ме­то­ды, по­тен­ци­аль­но спо­соб­ные ре­шить про­бле­му вы­яв­ле­ния и иден­ти­фи­ка­ции но­вых мик­ро­ор­га­низ­мов, уже по­яв­ля­ют­ся. Са­мый пер­спек­тив­ный — NGS (Next Gen­er­a­tion Se­quenc­ing), или се­кве­ни­ро­ва­ние но­во­го по­ко­ле­ния. «Неотъ­ем­ле­мая часть ме­то­да — эф­фек­тив­ные ма­те­ма­ти­че­ские ал­го­рит­мы, — объ­яс­ня­ет со­ав­тор об­зо­ра, ас­пи­рант­ка МФТИ Али­на Ма­ц­вай. — Они поз­во­ля­ют в про­цес­се чте­ния ге­но­ма неиз­вест­но­го ви­ру­са или дру­го­го мик­ро­ор­га­низ­ма „про­би­вать“ его по всем име­ю­щим­ся огром­ным ге­ном­ным биб­лио­те­кам, пред­ска­зы­вая все­воз­мож­ные свой­ства но­во­го ви­ру­са, и в том чис­ле его па­то­ген­ный по­тен­ци­ал».

Но неиз­вест­но, ко­гда этот ме­тод внед­рят в мас­со­вую прак­ти­ку. Для NGS нуж­но до­ро­гое обо­ру­до­ва­ние и ре­а­ген­ты, а сам про­цесс ис­сле­до­ва­ния за­ни­ма­ет мно­го вре­ме­ни. Еще одна про­бле­ма — жест­кие тре­бо­ва­ния к ква­ли­фи­ка­ции ла­бо­ра­тор­но­го пер­со­на­ла. Ка­миль Ха­физов уве­рен, что пан­де­мия ко­ро­на­ви­ру­са на­гляд­но по­ка­за­ла важ­ность ме­то­дов NGS в вы­яв­ле­нии но­вых па­то­ге­нов в кли­ни­че­ских об­раз­цах. Он на­де­ет­ся, что тех­но­ло­гия бу­дет сер­ти­фи­ци­ро­ва­на для при­ме­не­ния уже в бли­жай­шие годы.